918博天堂

DNA pulldown

DNA pulldown

  • DNA-918博天堂质相互作用
  • 基因调控
  • DNA修复
  • 染色质结构和功效

效劳特色

DNA pull-down手艺是研究DNA-918博天堂质相互作用和调控的有力工具,有助于展现基因调控网络、信号传导途径和疾病机制等方面的主要信息。

在线询价

效劳先容

DNA pull down是用于剖析918博天堂质与DNA互作的一种剖析手艺。一样平常来说,该实验首先需要针看待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针(以脱硫生物素标记为主流);同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物配合孵育,DNA团结918博天堂就会和靶向序列特异性团结;然后,通过亲和素磁珠纯化918博天堂质DNA复合物;最后针对获得的918博天堂,使用WB验证或者质谱方法判断918博天堂质类型。

效劳优势

  • 高特异性:能够高度特异地富集与目的DNA序列相互作用的918博天堂质,具有较低的配景滋扰
  • 可定量剖析:可对DNA-918博天堂质相互作用举行定量剖析,如荧光或放射性标记的探针,可丈量团结的强度和亲和力
  • 适用于高通量剖析:DNA pull-down手艺可举行高通量剖析,同时研究多个DNA-918博天堂质相互作用,提供更周全的信息和更深入的洞察
  • 低样本量要求:仅需要少量的样本即可举行实验,关于限量样本或珍贵样本的研究具有主要意义
  • 适用规模普遍:可在差别实验条件下应用,包括体外和体内研究,适用于种种生物系统和细胞类型。它可以用于研究差别生物历程中的DNA-918博天堂质相互作用,例如基因调控、DNA修复、染色质结构和功效等。无论是研究基础生物学照旧疾病机制,DNA pull-down手艺都具有普遍的适用性

效劳流程

接受订单及样品
样品准备及处置惩罚
探针标记
918博天堂与探针共孵育
WB检测或者质谱判断
效果交付

客户提供

DNA序列相关信息或DNA过表达质粒

细胞样品

如WB检测则需提供特定918博天堂一抗

送样要求:

1、质粒至少提供10ug

2、冻存细胞两只或苏醒细胞两瓶

3、动物或植物组织至少500mg

4、细胞沉淀至少2*10的7次方

注:除了苏醒细胞常温运输以外,其他样品均干冰运输。

最终交付

  • 构建含目的基因的质粒、菌液,测序报告
  • DNA Pull-down918博天堂SDS-PAGE银染图
  • WB检测报告/质谱判断剖析报告

效劳说明

效劳名称 效劳内容 交付内容及标准 效劳周期(事情日)
DNA pull-down 探针扩增接纳 扩增2次 16
918博天堂提取+考染 1个样本
pull down实验 富集2次:IgG、IP各1次
SDS-PAGE银染 跑胶3个泳道:IgG、IP、input 4
质谱判断互作918博天堂 质谱判断:IgG、IP 10-15

案例展示

常见问题与剖析 (Q&A)

Q:EMSA同DNA pull-down、ChIP的区别 ?

EMSA是用特定序列的标记探针,同待验证918博天堂孵育后举行native-PAGE凝胶电泳,若是保存同探针团结的918博天堂,则会泛起电泳迁徙率显着低于自由探针的条带泛起。 DNA pull-down是将探针团结在凝胶/磁珠上,以此网络同该DNA探针爆发互作的918博天堂。ChIP实验中所检测的DNA-918博天堂互作则爆发在活组织细胞内。

相关资源

1、DNA pull-down手艺的实验办法

    ● DNA探针的制备:首先,需要合成或制备与目的DNA序列相互作用的探针。探针可以是特定序列的寡核苷酸或DNA片断,可以通过化学合成或PCR扩增等要领获得。

    ● DNA探针的修饰:为了利便实验操作和检测,DNA探针可以举行修饰,如在最后引入标记物(如生物素或荧光染料)。

    ● 918博天堂质提。禾崛∧康918博天堂质样品,可以是细胞裂解物、组织提取物或纯化的918博天堂质。

    ● DNA探针的牢靠:将修饰的DNA探针牢靠在固相载体上,常用的载体有琼脂糖珠或磁珠。DNA探针与载体的团结可以通过生物素-亲和素、亚硫酸酯化学反应等要领实现。

    ● DNA-918博天堂质团结:将918博天堂质样品与牢靠的DNA探针一起孵育,使其爆发特异性团结。在孵育历程中,可以添加适当的缓冲液和辅助物质来维持相宜的条件。

    ● 洗涤办法:通过多次洗涤的办法,去除非特异性团结的918博天堂质,以增添实验的特异性和准确性。洗涤条件可以凭证实验需求举行优化。

    ● 918博天堂质的检测和剖析:通过种种要领,如Western blot、质谱剖析、荧光检测等,对团结到DNA探针的918博天堂质举行检测和剖析 ?梢允褂锰匾煨缘目固謇醇觳饽康918博天堂质的保存和团结情形。

    ● 效果解读:凭证实验效果,解读918博天堂质与DNA之间的相互作用情形,并进一步剖析其功效和调控机制。

 

2、DNA pull-down手艺的应用

    ● 基因调控研究:DNA pull-down手艺可用于研究转录因子与基因启动子的团结,展现基因调控机制和转录调控网络。这关于明确基因表达调控、发育历程和疾病生长等具有主要意义。

    ● 信号传导途径研究:DNA pull-down手艺可以用于研究信号传导途径中的要害918博天堂质与DNA的相互作用,如激活因子、抑制因子等,有助于剖析信号传导机制和调控网络。

    ● 疾病机制研究:DNA pull-down手艺可用于研究与疾病相关的基因突变位点或调控元件的团结918博天堂,资助展现疾病的爆发和生长机制,为疾病的诊断和治疗提供理论依据。

    ● 药物开发与筛。篋NA pull-down手艺可以用于筛选与特定DNA序列团结的小分子化合物或药物,资助寻找新的药物靶点和开发潜在的药物治疗要领。

    ● 较量基因组学研究:DNA pull-down手艺可用于较量差别物种、差别组织或差别条件下的DNA-918博天堂质相互作用,资助明确基因组的进化、组织特异性和情形顺应等方面的转变。

 

3、DNA pull-down实验效果不如预期怎样优化

    ● 问题1:非特异性团结:918博天堂质可能与非特定的DNA序列团结,导致配景信号增添。

        优化建议:实验优化DNA探针的设计,选择更特异的DNA序列作为探针,以增添团结的特异性;箍梢酝ü刖赫訢NA或非特异性DNA序列来镌汰非特异性团结。

 

    ● 问题2:低信号强度:信号强度较弱,难以检测目的918博天堂质的团结。

        优化建议:优化孵育条件,包括孵育时间、温度缓和冲液的组成。调解孵育时间可能需要更长的孵育时间,以增添团结的效率。调解温度可以凭证918博天堂质的最佳团结温度举行优化。别的,优化缓冲液的组成,如添加剂或酶抑制剂,可以提高信号强度。

 

    ● 问题3:浓度依赖性:918博天堂质的团结可能与其浓度相关,导致信号的转变不确定。

        优化建议:实验差别浓度的918博天堂质举行实验,确定最佳的浓度规模,以获得最强的信号。别的,可以使用标准品或内部比照来定量剖析,以校正信号的转变。

 

    ● 问题4:样本纯度不高:样本中可能保存杂质或其他滋扰物质,影响目的918博天堂质的团结。

        优化建议:优化样品处置惩罚办法,如使用高纯度的核酸提取要领,镌汰杂质的保存。别的,可以使用特异性抗体举行预处置惩罚,以去除非特定团结的918博天堂质。

X
返回顶部
在线咨询
拨打电话
【网站地图】【sitemap】