918博天堂

EMSA

EMSA

  • 核918博天堂提取
  • 验证型EMSA
  • 竞争型EMSA
  • 超迁徙EMSA
  • RNA/DNA团结918博天堂

效劳特色

金开瑞提供EMSA检测手艺效劳 ,资助您检测DNA团结918博天堂、RNA团结918博天堂、特定的918博天堂质 。

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效劳先容

凝胶迁徙或电泳迁徙率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay ,EMSA)是一种检测918博天堂质和DNA序列相互团结的手艺 ,可用于定性和定量剖析 。现在已用于研究DNA团结918博天堂和特定的DNA序列的相互作用 ,是转录因子研究的经典要领 。

验证型EMSA

?于验证探针是否含有可与蛋?质团结的位点 。将团结位点突变 ,以突变探针为比照 ,野?型探针泛起迁徙条带 ,?突变探针未泛起迁徙条带 ,则说明该探针含有可与蛋?质团结的位点 。

竞争型EMSA

探针序列稳固 ,不含修饰基团的探针称为冷探针 。冷探针与标记探针竞争性地与蛋?团结 ,冷探针不显影出迁徙条带 。以冷探针为比照 ,标记探针泛起迁徙条带 ,?冷探针迁徙条带削弱或消逝 ,则扫除了假阳性?扰 ,增添实验效果准确性 。

超迁徙EMSA

使??标蛋?的特异性抗体 ,蛋?-探针复合物被抗体识别并团结 ,该三聚复合物在凝胶电泳中 ,迁徙速率再次增? ,泛起在蛋?-探针复合物的上?的超迁徙条带 ,验证了探针与?的蛋?的特异性团结 。

效劳优势

  • 直接测定918博天堂质与核酸的相互作用 ,提供定性和定量信息 。
  • 可用于研究多种类型的相互作用 ,如特异性团结、非特异性团结、序列特异性等 。
  • 手艺简朴 ,实验操作相对容易 。
  • 可以使用差别的标记要领和检测手艺举行顺应差别实验需求 。

效劳流程

吸收订单及样品
实验设计
合成探针
EMSA电泳凝胶设置
EMSA反应
电泳检测
显色反应
效果交付

客户提供

需提取核918博天堂的细胞>10^7 ,动物组织不少于400 mg ,植物组织不少于2 g ,建议客户在金开瑞表达重组918博天堂;

探针序列;

如使用团结918博天堂特异性抗体 ,抗体50 μL以上 ,浓度大于0.5 mg/mL 。

效劳说明

特殊说明:

? EMSA亦可?于研究RNA团结蛋?和其相关RNA序列的相互作? 

? 如需要做超迁徙 ,需提供IP级别的抗体

? EMSA与酵?单杂交 ,可配合验证同?个问题
 

效劳名称 效劳内容 交付内容及标准 效劳周期(事情日)
DNA探针标记 探针标记及合成  (≤59bp) 探针退火最少1次  (1组探针退火1次) 7-10
探针标记及合成  (60bp-300bp) 918博天堂孵育最少1次 12-16
RNA探针标记 探针标记及合成  (<60bp) 探针标记 7-10
EMSA EMSA 10个泳道(包括阴性和阳性比照) 10

案例展示

常见问题与剖析 (Q&A)

Q:EMSA的应用在哪些地方?

凝胶迁徙或电泳迁徙率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay ,EMSA)是一种检测918博天堂质和DNA序列相互团结的手艺 ,可用于定性和定量剖析;现在已用于研究RNA团结918博天堂和特定的RNA序列的相互作用 ,是转录因子研究的经典要领 。 金开瑞提供EMSA检测手艺效劳 ,资助您检测DNA团结918博天堂、RNA团结918博天堂、特定的918博天堂质 ,并可举行未知918博天堂的判断 。

Q:supershift EMSA是指的什么?

当客户用组织或细胞核918博天堂举行实验时 ,无法确定与探针团结的详细918博天堂 ,需要再提供要研究的抗体 ,再举行supershift实验 。若是抗体能识别与探针团结的918博天堂 ,则会泛起一条超迁徙条带 ,即可证实探针与918博天堂的团结 。需客户提供IP级别的抗体 。

Q:EMSA实验所用918博天堂怎样获得?

使用自然组织细胞样本举行实验 ,通过抽提核918博天堂获取目的918博天堂 ,此为混淆918博天堂 ,如要确定某个918博天堂团结于探针时 ,需要加入抗体视察是否形成超迁徙条带 ?梢酝ü刈918博天堂表达系统(如金开瑞的大肠、酵母、哺乳、无细胞等)获得特定的重组918博天堂 ,后续实验中如泛起迁徙条带 ,则应源于该918博天堂的结相助用 。

Q:EMSA实验保存哪些主要危害?

除了探针序列具有理论展望性、自己属于探索性实验的情形之外 ,组织细胞中该转录因子品貌较低、只在特定条件阶段表达 ,特定918博天堂同DNA团结需要一定的离子或辅助因子条件(如Mg2+、Zn2+、ATP) ,重组表达918博天堂在DNA团结活性方面同自然918博天堂保存差别 ,结协力较弱 ,需要其他918博天堂间接作用于DNA等情形下 ,都难以获得迁徙条带 。别的 ,当研究的918博天堂自己pI较大(如大于8.0) ,918博天堂在native电泳中将难以随同DNA一起向阳极泳动 ,或在电泳最初阶段同DNA解脱离 。

相关资源

1、EMSA的实验办法

    ? 准备918博天堂质和核酸:获得目的918博天堂质和响应的DNA或RNA探针 。918博天堂质可以是纯化的重组918博天堂质或细胞提取物 。

    ? 准备核酸标记:对DNA或RNA探针举行标记 ,常见的标记方法包括放射性标记(例如32P或35S)或非放射性标记(例如荧光标记或生物素标记) 。

    ? 反应混淆:将标记的核酸探针与918博天堂质样品混淆 ,添加反应缓冲液 ,包括缓冲盐、非特异性竞争物和非特异性DNA或RNA 。

    ? 反应举行:将反应混淆物在适当的温度和时间下孵育 ,以促使918博天堂质与核酸团结形成复合物 。

    ? 电泳:将反应混淆物加载到聚丙烯酰胺凝胶电泳槽中 ,举行电泳疏散 。在非变性条件下举行电泳可以坚持918博天堂质与核酸的团结 。

    ? 凝胶牢靠和成像:电泳竣事后 ,凝胶牢靠并举行成像 ,例如通过放射线照射敏感的凝胶后 ,通过放射自显影或荧光成像检测标记的核酸探针 。

    ? 效果剖析:剖析凝胶图像 ,视察是否有918博天堂质-核酸复合物的形成 。918博天堂质-核酸团结会导致迁徙速率的减慢或带移动位置的改变 。

 

2、EMSA的应用

    EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay)是一种常用的实验手艺 ,用于研究918博天堂质与核酸(DNA或RNA)之间的相互作用 。它在许多研究领域中获得普遍应用 ,包括但不限于以下几个方面:

    ● 转录因子研究:EMSA可用于研究转录因子与DNA的团结 。通太过析转录因子与特定基因启动子或调控元件的团结能力 ,可以展现基因调控网络和转录调控机制 。

    ● RNA团结918博天堂研究:EMSA可用于研究RNA团结918博天堂(RNA-binding proteins ,RBPs)与RNA的相互作用 。通过探讨RBPs与目的RNA序列的团结 ,可以相识RBPs在转录后调控、RNA稳固性和翻译调控等历程中的功效 。

    ● DNA修复和损伤识别:EMSA可用于研究DNA修复酶和损伤识别918博天堂与DNA损伤位点的团结 。通太过析这些相互作用 ,可以深入相识DNA修复机制和DNA损伤应答通路 。

    ● 药物筛选和药物靶点研究:EMSA可用于筛选和评估潜在药物分子与特定DNA或RNA序列的团结能力 。通过检测药物与靶点的相互作用 ,可以评估药物的亲和力和选择性 ,为药物开发和靶向治疗提供主要信息 。

    ● 基因调控网络研究:EMSA可用于研究基因调控网络中的转录因子与调控元件之间的相互作用 。通太过析转录因子与特定启动子或增强子序列的团结 ,可以展现基因调控网络的结构和功效 ,以及转录因子在调控基因表达中的作用 。

    ● 疾病相关基因的功效研究:EMSA可用于研究与疾病相关的基因的功效调控 。通太过析疾病相关基因的启动子、增强子或调控元件与转录因子的团结 ,可以相识这些基因的调控机制和与疾病相关的功效转变 。

 

3、918博天堂质与核酸之间的相互作用有哪些 ,常用哪些手艺去检测?

    ? 918博天堂质与核酸之间的相互作用包括转录因子与DNA的团结、RNA团结918博天堂与RNA的团结以及其他918博天堂质与DNA或RNA的相互作用等 。常用的手艺用于检测这些相互作用的要领包括:

    ? 电泳迁徙实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA):通过电泳迁徙剖析918博天堂质与DNA或RNA团结的迁徙差别 。该要领基于918博天堂质与核酸团结后形成复合物的迁徙速率差别 ,可定性剖析相互作用的保存与否 。

    ? 共沉淀实验(Co-precipitation Assay):使用特定的亲和剂或抗体富集与目的918博天堂质相互作用的DNA或RNA分子 。该要领可用于定性和定量剖析相互作用的强度和特异性 。

    ? 免疫共沉淀实验(Immunoprecipitation, IP):使用特定抗体选择性地富集目的918博天堂质及其团结的核酸 。该要领通过918博天堂质-抗体互作用实现918博天堂质与核酸的联络 ,可用于判断和定量剖析相互作用的918博天堂质和核酸分子 。

    ? 酵母双杂交(Yeast Two-Hybrid, Y2H):通过使用酵母细胞内的转录激活和检测系统 ,研究918博天堂质与918博天堂质之间的相互作用 。该要领可用于筛选和判断918博天堂质-918博天堂质相互作用的交互配对 。

    ? 外貌等离子共振(Surface Plasmon Resonance, SPR):通过监测918博天堂质与核酸相互作用引起的光信号转变 ,实时丈量它们的团结动力学和亲和力 。该手艺可提供定量的团结强度、关联息争离速率等信息 。

    ? RNA pull down:使用特定的RNA分子富集与目的RNA团结的918博天堂质 。该要领可用于判断与RNA相互作用的918博天堂质 ,从而展现RNA的功效和调控机制 。

    ? DNA pull down:使用特定的DNA序列富集与目的DNA团结的918博天堂质 。该要领可用于研究与DNA团结的918博天堂质 ,如转录因子和其他DNA团结918博天堂质 。

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