EMSA
- 核918博天堂提取
- 验证型EMSA
- 竞争型EMSA
- 超迁徙EMSA
- RNA/DNA团结918博天堂
效劳特色
金开瑞提供EMSA检测手艺效劳,资助您检测DNA团结918博天堂、RNA团结918博天堂、特定的918博天堂质。
效劳先容
凝胶迁徙或电泳迁徙率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)是一种检测918博天堂质和DNA序列相互团结的手艺,可用于定性和定量剖析。现在已用于研究DNA团结918博天堂和特定的DNA序列的相互作用,是转录因子研究的经典要领。
验证型EMSA
?于验证探针是否含有可与蛋?质团结的位点。将团结位点突变,以突变探针为比照,野?型探针泛起迁徙条带,?突变探针未泛起迁徙条带,则说明该探针含有可与蛋?质团结的位点。
竞争型EMSA
探针序列稳固,不含修饰基团的探针称为冷探针。冷探针与标记探针竞争性地与蛋?团结,冷探针不显影出迁徙条带。以冷探针为比照,标记探针泛起迁徙条带,?冷探针迁徙条带削弱或消逝,则扫除了假阳性?扰,增添实验效果准确性。
超迁徙EMSA
使??标蛋?的特异性抗体,蛋?-探针复合物被抗体识别并团结,该三聚复合物在凝胶电泳中,迁徙速率再次增?,泛起在蛋?-探针复合物的上?的超迁徙条带,验证了探针与?的蛋?的特异性团结。
效劳优势
- 直接测定918博天堂质与核酸的相互作用,提供定性和定量信息。
- 可用于研究多种类型的相互作用,如特异性团结、非特异性团结、序列特异性等。
- 手艺简朴,实验操作相对容易。
- 可以使用差别的标记要领和检测手艺举行顺应差别实验需求。
效劳流程
客户提供
需提取核918博天堂的细胞>10^7,动物组织不少于400 mg,植物组织不少于2 g,建议客户在金开瑞表达重组918博天堂;
探针序列;
如使用团结918博天堂特异性抗体,抗体50 μL以上,浓度大于0.5 mg/mL。
效劳说明
特殊说明:
? EMSA亦可?于研究RNA团结蛋?和其相关RNA序列的相互作?
? 如需要做超迁徙,需提供IP级别的抗体
? EMSA与酵?单杂交,可配合验证同?个问题
效劳名称 | 效劳内容 | 交付内容及标准 | 效劳周期(事情日) |
DNA探针标记 | 探针标记及合成 (≤59bp) | 探针退火最少1次 (1组探针退火1次) | 7-10 |
探针标记及合成 (60bp-300bp) | 918博天堂孵育最少1次 | 12-16 | |
RNA探针标记 | 探针标记及合成 (<60bp) | 探针标记 | 7-10 |
EMSA | EMSA | 10个泳道(包括阴性和阳性比照) | 10 |
案例展示
常见问题与剖析 (Q&A)
凝胶迁徙或电泳迁徙率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)是一种检测918博天堂质和DNA序列相互团结的手艺,可用于定性和定量剖析;现在已用于研究RNA团结918博天堂和特定的RNA序列的相互作用,是转录因子研究的经典要领。 金开瑞提供EMSA检测手艺效劳,资助您检测DNA团结918博天堂、RNA团结918博天堂、特定的918博天堂质,并可举行未知918博天堂的判断。
当客户用组织或细胞核918博天堂举行实验时,无法确定与探针团结的详细918博天堂,需要再提供要研究的抗体,再举行supershift实验。若是抗体能识别与探针团结的918博天堂,则会泛起一条超迁徙条带,即可证实探针与918博天堂的团结。需客户提供IP级别的抗体。
使用自然组织细胞样本举行实验,通过抽提核918博天堂获取目的918博天堂,此为混淆918博天堂,如要确定某个918博天堂团结于探针时,需要加入抗体视察是否形成超迁徙条带?梢酝ü刈918博天堂表达系统(如金开瑞的大肠、酵母、哺乳、无细胞等)获得特定的重组918博天堂,后续实验中如泛起迁徙条带,则应源于该918博天堂的结相助用。
除了探针序列具有理论展望性、自己属于探索性实验的情形之外,组织细胞中该转录因子品貌较低、只在特定条件阶段表达,特定918博天堂同DNA团结需要一定的离子或辅助因子条件(如Mg2+、Zn2+、ATP),重组表达918博天堂在DNA团结活性方面同自然918博天堂保存差别,结协力较弱,需要其他918博天堂间接作用于DNA等情形下,都难以获得迁徙条带。别的,当研究的918博天堂自己pI较大(如大于8.0),918博天堂在native电泳中将难以随同DNA一起向阳极泳动,或在电泳最初阶段同DNA解脱离。
相关手艺效劳
? 修饰/标记引物 | ? 双荧光素酶报告系统 | ? 酵母单杂交 |
? CO-IP | ? RNA pull-down | ? RIP-qPCR |
? DNA pull-down | ? ChIP-qPCR | ? 酵母单杂交 |
? CUT&Tag |
相关资源
1、EMSA的实验办法
? 准备918博天堂质和核酸:获得目的918博天堂质和响应的DNA或RNA探针。918博天堂质可以是纯化的重组918博天堂质或细胞提取物。
? 准备核酸标记:对DNA或RNA探针举行标记,常见的标记方法包括放射性标记(例如32P或35S)或非放射性标记(例如荧光标记或生物素标记)。
? 反应混淆:将标记的核酸探针与918博天堂质样品混淆,添加反应缓冲液,包括缓冲盐、非特异性竞争物和非特异性DNA或RNA。
? 反应举行:将反应混淆物在适当的温度和时间下孵育,以促使918博天堂质与核酸团结形成复合物。
? 电泳:将反应混淆物加载到聚丙烯酰胺凝胶电泳槽中,举行电泳疏散。在非变性条件下举行电泳可以坚持918博天堂质与核酸的团结。
? 凝胶牢靠和成像:电泳竣事后,凝胶牢靠并举行成像,例如通过放射线照射敏感的凝胶后,通过放射自显影或荧光成像检测标记的核酸探针。
? 效果剖析:剖析凝胶图像,视察是否有918博天堂质-核酸复合物的形成。918博天堂质-核酸团结会导致迁徙速率的减慢或带移动位置的改变。
2、EMSA的应用
EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay)是一种常用的实验手艺,用于研究918博天堂质与核酸(DNA或RNA)之间的相互作用。它在许多研究领域中获得普遍应用,包括但不限于以下几个方面:
● 转录因子研究:EMSA可用于研究转录因子与DNA的团结。通太过析转录因子与特定基因启动子或调控元件的团结能力,可以展现基因调控网络和转录调控机制。
● RNA团结918博天堂研究:EMSA可用于研究RNA团结918博天堂(RNA-binding proteins,RBPs)与RNA的相互作用。通过探讨RBPs与目的RNA序列的团结,可以相识RBPs在转录后调控、RNA稳固性和翻译调控等历程中的功效。
● DNA修复和损伤识别:EMSA可用于研究DNA修复酶和损伤识别918博天堂与DNA损伤位点的团结。通太过析这些相互作用,可以深入相识DNA修复机制和DNA损伤应答通路。
● 药物筛选和药物靶点研究:EMSA可用于筛选和评估潜在药物分子与特定DNA或RNA序列的团结能力。通过检测药物与靶点的相互作用,可以评估药物的亲和力和选择性,为药物开发和靶向治疗提供主要信息。
● 基因调控网络研究:EMSA可用于研究基因调控网络中的转录因子与调控元件之间的相互作用。通太过析转录因子与特定启动子或增强子序列的团结,可以展现基因调控网络的结构和功效,以及转录因子在调控基因表达中的作用。
● 疾病相关基因的功效研究:EMSA可用于研究与疾病相关的基因的功效调控。通太过析疾病相关基因的启动子、增强子或调控元件与转录因子的团结,可以相识这些基因的调控机制和与疾病相关的功效转变。
3、918博天堂质与核酸之间的相互作用有哪些,常用哪些手艺去检测?
? 918博天堂质与核酸之间的相互作用包括转录因子与DNA的团结、RNA团结918博天堂与RNA的团结以及其他918博天堂质与DNA或RNA的相互作用等。常用的手艺用于检测这些相互作用的要领包括:
? 电泳迁徙实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA):通过电泳迁徙剖析918博天堂质与DNA或RNA团结的迁徙差别。该要领基于918博天堂质与核酸团结后形成复合物的迁徙速率差别,可定性剖析相互作用的保存与否。
? 共沉淀实验(Co-precipitation Assay):使用特定的亲和剂或抗体富集与目的918博天堂质相互作用的DNA或RNA分子。该要领可用于定性和定量剖析相互作用的强度和特异性。
? 免疫共沉淀实验(Immunoprecipitation, IP):使用特定抗体选择性地富集目的918博天堂质及其团结的核酸。该要领通过918博天堂质-抗体互作用实现918博天堂质与核酸的联络,可用于判断和定量剖析相互作用的918博天堂质和核酸分子。
? 酵母双杂交(Yeast Two-Hybrid, Y2H):通过使用酵母细胞内的转录激活和检测系统,研究918博天堂质与918博天堂质之间的相互作用。该要领可用于筛选和判断918博天堂质-918博天堂质相互作用的交互配对。
? 外貌等离子共振(Surface Plasmon Resonance, SPR):通过监测918博天堂质与核酸相互作用引起的光信号转变,实时丈量它们的团结动力学和亲和力。该手艺可提供定量的团结强度、关联息争离速率等信息。
? RNA pull down:使用特定的RNA分子富集与目的RNA团结的918博天堂质。该要领可用于判断与RNA相互作用的918博天堂质,从而展现RNA的功效和调控机制。
? DNA pull down:使用特定的DNA序列富集与目的DNA团结的918博天堂质。该要领可用于研究与DNA团结的918博天堂质,如转录因子和其他DNA团结918博天堂质。