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引物合成

引物合成

  • 可监控每条引物的合成质量
  • 多重质量检测手段
  • 周全包管发货的质量

效劳特色

金开瑞引物合成平台引进天下上现在主流的合成仪制造商BLP公司生产的nm级别的Dr.oligo192高通量DNA合成仪  ,天天的通量可达2000条/台 。

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效劳先容

引物合成是一种生物手艺  ,用于合成DNA或RNA的短链分子  ,通常用于PCR(聚合酶链反应)和其他分子生物学实验中 。引物是一段短链分子  ,通常包括20-30个碱基  ,能够与特定的DNA或RNA序列互补配对  ,从而指导聚合酶在该序列上扩增DNA 。引物合成通常使用自动化合成要领  ,在化学合成仪上一步步添加碱基来构建所需的序列 。引物合成手艺的生长使得DNA和RNA序列的快速和准确合成成为可能  ,为生物手艺和生物医学研究提供了主要的支持 。

常见问题

Q:测定了制品的OD值后发明OD260/OD280<1.8  ,制品质量 (纯度) 及格吗?

由于核酸在260 nm周围有强吸收  ,而918博天堂质在280 nm周围有强吸收  ,从生物体内提取核酸时  ,常用OD260/OD280比值来评价核酸纯度 (比值在1.8~2.0之间)  ,这一判断是基于序列中A、G、C、T所占比例大致相同时的效果 。而合成的DNA/RNA则差别  ,序列很短 (通常在20~30个碱基之间)  ,其中A、G、C、T种种碱基所占比例很不相同  ,由于种种碱基的摩尔消光系数差别  ,因此差别碱基组成的合成DNA/RNA制品的OD260/OD280比值也差别  ,例如当序列中C、T碱基的含量高时  ,该比值会大大低于1.8 。别的  ,序列中碱基的排列顺序也影响该比值 。以是不可凭证OD260/OD280比值来评价合成DNA/RNA制品的纯度 。

Q:使用3%的Agarose凝胶电泳合成Oligo DNA制品  ,发明有许多条泳带  ,为什么?

Oligo DNA的电泳一定要使用变性PAGE电泳 。Oligo DNA是单链DNA  ,容易形成重大的立体结构  ,因此举行Agarose电泳时  ,容易泛起多条泳带 (更无法用Agarose电泳举行定量了) 。

Q:举行PAGE电泳时  ,长度完全一样的Oligo DNA为什么泳带不在统一位置?

A、G、C、T的组份差别  ,电泳速率差别; DNA的立体结构差别  ,电泳速率差别 。 这种情形在Oligo DNA越短时越容易爆发  ,长链Oligo DNA之间差别越小 。

Q:一样平常的合成Oligo DNA的5' 和3' 最后有磷酸基团吗?

没有  ,5' 和3' 最后均为-OH基 。如需要加磷酸基团  ,订货时请特殊注明  ,此时需收取磷酸化 (PO4修饰) 的用度 。

Q:能否凭证电泳带的亮度对合成的DNA/RNA制品举行定量?

不可 。 由于EtBr是通过嵌入到核酸的双螺旋间而使其着色的 。合成的DNA/RNA分子为单链  ,只有通过自身回折形成局部发夹环结构或链间形成部分双螺旋结构  ,才华被EtBr染色 。由于差别制品的序列差别  ,形成双螺旋的能力差别  ,因此染色能力不尽相同  ,也就不可凭证EtBr染色带的亮度来对合成的DNA/RNA举行定量 。

Q:引物片断退火后不可毗连到载体上是什么缘故原由?

毗连反应的引物若是没有5’磷酸基团  ,毗连效率相对较低  ,但不是完全不可乐成 。 若是磷酸化的产品还不可毗连载体上  ,需要检查载体的酶切效果以及核对引物的设计计划  ,若是都没有问题就要思量改善引物退火的条件以及毗连反应系统 。

Q:贵公司可合成多长的DNA  ,多长的RNA?

合成DNA的长度为6~130个碱基;合成RNA的长度为8~35个碱基 。当合成的DNA序列较长时  ,由于合成及纯化要领的限制,很难包管制品中每个序列都准确无误 。别的需要说明的是:若是待合成序列较量特殊 (例如多个“G”一连泛起等)  ,合成收率相对较低  ,我们可能会凭证详细情形加收用度;有时我们也可能无法合成订购的序列  ,此时本公司保存不接受定单的权力 。

Q:合成的DNA应怎样生涯?

干燥制品很稳固  ,-20℃下生涯2年没问题 。 消融后的DNA也请生涯于-20℃  ,最好是分份生涯  ,阻止重复冻融 。 溶液中的Oligo DNA在常温下安排3~4天应该没问题  ,但最好不要安排一个星期以上 。其寿命与容器、溶剂的灭菌水平有关 。

Q:已经消融的引物  ,为什么原先使用正常  ,而过一段时间再使用就欠好了?

若是您消融引物的水PH过低或污染了菌或核酸酶  ,会使引物降解 。使用时没有充分解冻混淆  ,液体不匀称也可能会造成引物加入量禁绝确 。建议分装引物  ,阻止重复冻溶 。建议使用10mM Tris pH7.5缓冲液消融引物  ,由于有些蒸馏水的pH值较量低(pH4-5), 引物在这种条件下不稳固 I杏幸恢挚赡苄允且锩挥形侍  ,而是PCR使用质料特殊是模板的质量与先前使用的不完全一致 。

Q:引物质量优劣的判断标准是什么?

合成的引物和您的定单序列一致  ,而不是能否扩增出您所需要的产品 。

Q:怎样才华包管Oligo DNA的准确性?

合成Oligo DNA时  ,只管选用高纯度级制品 。 阻止使用过长的Oligo DNA  ,最好选用小于35 mer的合成DNA制品 。 举行克隆实验时  ,每次克隆都须举行测序验证  ,以包管序列的准确性  ,然后再举行进一步实验 。举行918博天堂表达实验时  ,尤其需要注重 。

Q:合成的DNA/RNA制品消融后发明有少许沉淀  ,会影响实验效果吗?

所有的制品纯化后都要举行脱盐  ,脱盐是使用C18柱举行的  ,偶而会有微量的树脂溢出而进入制品 。树脂不影响任何反应效果  ,请稍许离心后取上清使用 。

Q:平端的PCR产品难以克隆  ,为什么?

由于一样平常的PCR用引物的5′ 最后都没有磷酸基团  ,因此  ,扩增后的PCR产品的5′ 最后也没有磷酸基团 。当克隆于去磷酸化的最后平滑载体时  ,无法克隆进去;而当克隆于非去磷酸化的最后平滑载体时  ,配景会极高 。此时请对PCR产品的5′ 端举行磷酸 (PO4修饰) 化处置惩罚 。

Q:合成的引物举行PCR反应时无目的带  ,怎么办?

PCR反应失败的缘故原由许多  ,可以从以下几个方面思量 。 1. 引物和模板是否配对  ,同源性有多大? 2. 引物自己是否有立体结构  ,或者二条引物之间是否形成高次结构? 3. PCR反应用试剂是否能正常事情? 4. PCR仪是否事情正常? 5. PCR反应条件是否合适? 若是一切正常  ,还无法解决问题时  ,我们可以免费重新合成引物 。若是重新合成的引物也无法解决问题时  ,请把引物和模板寄送给我们公司  ,我们可以资助探索PCR反应条件 。

Q:PCR扩增不出是引物有问题吗?

基本不是 。当今生长出林林总总的PCR扩增手艺  ,林林总总的高温聚合酶  ,就是来解决PCR扩增中遇到的扩不出  ,扩增效率低的问题 。如槽式PCR就是扩增那些拷贝数很低的基因片断 。 有些重复片断的扩增, GC含量高的片断  ,非要接纳特殊扩增手段才华扩增出了 。 引物扩增不出  ,主要是下列两种情形较量常见: RT-PCR 。请注重  ,许多基因通过通例RT–PCR要领是很难不增出来的 。 RT- PCR乐成的要害在于RT的反应的RNA质量和目的基因在特定组织和细胞中含量 。 从基因组中扩增 。一样平常情形下  ,基因在基因组中都是单拷贝  ,基因组作为模板需要严酷控制用量 ;蜃镈NA过高  ,会影响反应系统中的Mg和pH 。

Q:怎样对合成DNA/RNA制品举行定量、怎样测定并盘算OD值?

由于核酸在260 nm周围有强吸收  ,因此常凭证此性子  ,用紫外分光光度计测定核酸溶液在260 nm的吸光度值  ,据此对核酸举行定量  ,用OD值来体现 。1 OD是指:置于光路长度为1 cm的比色皿中的DNA/RNA溶液  ,若是其在260 nm处的吸光度值为1  ,则称1 ml该溶液中消融的DNA/RNA的量为1 OD 。1个OD值的合成DNA/RNA的质量约为33 μg 。将DNA/RNA溶液举行适当稀释  ,使吸光度测定值与样品浓度的关系在直线规模内  ,再凭证原溶液的总体积与稀释倍数盘算该溶液的总OD值 。 例如  ,一个200 μl的DNA/RNA溶液  ,若是对其举行6倍稀释  ,测定值为1.0时  ,则该溶液的总OD值为:0.2 ml×6×1.0 OD/ml=1.2 OD  。

Q:贵公司可合成多长的DNA  ,多长的RNA?

合成DNA的长度为6~130个碱基;合成RNA的长度为8~35个碱基 。当合成的DNA序列较长时  ,由于合成及纯化要领的限制,很难包管制品中每个序列都准确无误 。别的需要说明的是:若是待合成序列较量特殊 (例如多个“G”一连泛起等)  ,合成收率相对较低  ,我们可能会凭证详细情形加收用度;有时我们也可能无法合成订购的序列  ,此时本公司保存不接受定单的权力 。

Q:合成DNA的长度为6~130个碱基;合成RNA的长度为8~35个碱基 。当合成的DNA序列较长时  ,由于合成及纯化要领的限制,很难包管制品中每个序列都准确无误 。别的需要说明的是:若是待合成序列较量特殊 (例如多个“G”一连泛起等)  ,合成收率相对较低  ,我们可能会凭证详细情形加收用度;有时我们也可能无法合成订购的序列  ,此时本公司保存不接受定单的权力 。

没有  ,5' 和3' 最后均为-OH基 。如需要加磷酸基团  ,订货时请特殊注明  ,此时需收取磷酸化 (PO4修饰) 的用度 。

Q:合成的DNA应怎样生涯?

干燥制品很稳固  ,-20℃下生涯2年没问题 。 消融后的DNA也请生涯于-20℃  ,最好是分份生涯  ,阻止重复冻融 。 溶液中的Oligo DNA在常温下安排3~4天应该没问题  ,但最好不要安排一个星期以上 。其寿命与容器、溶剂的灭菌水平有关 。

Q:合成的DNA应怎样生涯?

干燥制品很稳固  ,-20℃下生涯2年没问题 。 消融后的DNA也请生涯于-20℃  ,最好是分份生涯  ,阻止重复冻融 。 溶液中的Oligo DNA在常温下安排3~4天应该没问题  ,但最好不要安排一个星期以上 。其寿命与容器、溶剂的灭菌水平有关 。

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